武林三游戏中暗器在升级达到七阶之后还有开启另一个系统就是灵石系统,灵石系统共12个镶嵌格子每一个格子都需要暗器进阶石来开启,所以暗器的进阶石不单单只是为了升级暗器等阶,每开启一个格子下一个就需要更多的暗器进阶石,固定值类型的灵石只能镶嵌在固定值类型的格子处,单项百分比的属性灵石只能镶嵌在单项百分比属性类型的格子处,同种属性类型的灵石只能镶嵌1个,全属性类型的的灵石可镶嵌在最后2个特殊镶嵌上,最多可镶嵌2个,灵石增加属性直接附加至玩家身上,不会显示在暗器属性内,同品质同属性灵石可合成为高等级灵石,灵石可在相关的运营活动中获得。
灵石增加攻击、防御、生命、闪避、命中、暗器攻击百分比伤害,防御百分比,生命值、命中、闪避以及全属性的百分比,灵石也分等级和属性例如灵石攻击Lv6级的攻击,镶嵌在该属性元灵上增加攻击8000。灵石强攻5级的增加暗器攻击的百分10%的属性伤害,并且如果有相同的灵石3个可合成为更高等级的灵石。